Entre les seves moltes obres, la primera que es va conèixer als països catalans va ser Cosi Fan Tutte, a Barcelona (1798).

Llistat d’obres:

- 41 simfonies, entre les que destaquen:
- Simfonia núm. 35 Haffner en re major, KV 385, (juliol-agost 1782),
- Simfonia núm. 36 Linz en do major, KV 425, (novembre 1783),
- Simfonia núm. 38 Praga en re major, KV 504, (finals 1786),
- Simfonia núm. 39 en mi bemoll major, KV 543, (juliol-agost 1788),
- Simfonia núm. 40 en sol menor, KV 550, (juliol-agost 1788) i
- Simfonia núm. 41 Júpiter en do major, KV 551, ) (juliol-agost 1788);

- Concerts (27 per a piano, 5 per a violí i diversos per a altres instruments)
- Sonates
- Música de cambra (duets, trios, quartets i quintets)
- 61 divertiments
- Serenates com per exemple Eine kleine Nachtmusik
- Marxes
- 22 òperes, a partir de 1781, i després d'algunes òperes menors, arribarien els seus grans títols :
     -Idomeneo (1781)
     -El rapte del serrall (1782), singspiel, considerada la primera gran òpera còmica alemanya
     -Les noces de Fígaro (1786)
     -Don Giovanni (1787)
     -Così fan tutte (Així fan totes, 1790), escrites les tres últimes en italià amb llibrets de Lorenzo da Ponte
     -La flauta màgica (1791), en la qual es reflecteixen els ritus i ideals maçònics
     -La clemenza di Tito (1791).